Quels probiotiques pour pour pallier le manque d'énergie

Quelles souches de probiotiques pour les mitochondries ?
Soutenir les mitochondries pour pallier le manque d’énergie
Les mitochondries sont les centrales énergétiques à l’intérieur de nos cellules. Si elles tournent au ralenti, en cas de dysbiose par exemple, cela a un impact important sur notre métabolisme et notre niveau d’énergie.
Vous pouvez avoir une bonne produc­tion d’ATP (notre carburant) ou une production faible d’ATP, et cela va déterminer votre niveau d’énergie global, ce qui va vous permettre de vous sentir en forme, d’avoir un cerveau alerte, des muscles réactifs, etc.
Préambule

Voyez ce post comme un endroit « ressources » où vous trouverez des liens utiles. Pour approfondir un sujet, nous ouvrirons un post annexe, avec un lien ici en renvoi, si pertinent.

NB : Inspiré librement de l’article paru dans SCE de mars 2023 – Dr Antonello D’Oro. (1)

Ce phénomène affecte vos mitochondries !
Si quelqu’un a une faible diver­sité dans son microbiote, il se peut qu’il n’ait pas les bonnes souches de bactéries intesti­nales responsables de la produc­tion d’urolithine A. Dès lors, on comprend qu’une dysbiose intes­tinale, avec une diminution de la diversité du microbiote, conduise à réduire la production d’acides gras à chaîne courte, la produc­tion d’urolithines et la produc­tion de lactate, ce qui va affecter la santé des mitochondries. Nous savons aussi que la réduction de ces métabolites du microbiote et l’altération des mitochondries sont impliquées dans diverses maladies comme les maladies inflammatoires de l’intestin, le diabète de type 2, le cancer colorectal, etc. Dès lors, nous comprenons qu’une modula­tion intelligente du microbiome pourrait avoir un impact et un intérêt significatif dans l’amélio­ration de la plupart des maladies chroniques.

Un microbiote sain pour des mitochondries saines
Penchons-nous sur certains méta­bolites produits par un microbiote sain et qui jouent un rôle important sur la santé de nos mitochondries, à savoir : le butyrate, chef de file des acides gras à chaîne courte, et les urolithines.

Le carburant de vos mitochondries
Les bonnes bactéries, en fermentant les fibres alimentaires, produisent des acides gras à chaîne courte qui sont essentiels à votre santé. Les acides gras à chaîne courte comprennent le butyrate, le propionate ou l’acétate. Le butyrate, en particulier, est une source d’énergie primaire très impor­tante pour de nombreuses cellules de votre corps, y compris toutes les cellules qui tapissent le gros intestin comme les colonocytes. De nombreuses cellules immunitaires, telles que les cellules dendritiques et les macrophages, utilisent le butyrate comme source d’énergie primaire. Le butyrate, au‑delà de tout cela, est également un signal métabo­lique très important. Il active l’AMP cyclique qui indique aux cellules, aux mitochondries, quand commen­cer à brûler les acides gras comme carburant. Cela permet à la machine­rie cellulaire de brûler les graisses de façon durable et de créer ainsi une production d’énergie de longue durée (9).
NDLR : On trouve du butyrate dans le beurre (+/ 3 gr) et le fromage à pâte dure et mi-dure (+/ 1 gr) ; mais vraiment très peu dans le lait (négligeable). 
=> Par exemple le gruyère, le cheddar, le parmesan, le gouda ou encore le bleu.
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Voici comment produire des mitochondries saines
Les urolithines sont également une classe de composés très intéressants. Ce sont des dérivés de polyphénols que l’on trouve dans les végétaux. Toutefois, par l’alimentation, nous ne pouvons pas vraiment obtenir de niveaux élevés d’urolithines, car il n’y a pas d’aliments que nous puissions manger qui en soient très riches. On sait toutefois que ce sont les aliments riches en acide ellagique qui peuvent être transformés par certaines bactéries intestinales en urolithine A, l’un des promoteurs les plus puissants de la mitophagie (10). On trouve de l’acide ellagique en petites quantités dans les baies et les fruits rouges, et en quantité un peu plus importante dans les grenades et les châtaignes. Toutefois, c’est votre microbiote qui convertit ce polyphé­nol en urolithines, et en particulier en un composé appelé urolithine A. Les urolithines sont des composés de signalisation très importants pour la santé des mitochondries, parti­culièrement pour la mitophagie (11). Pour rappel, la mitophagie consiste à éliminer par autophagie les mito­chondries dysfonctionnelles. Il est important que le corps puisse les digérer chimiquement afin de reconstruire de nouvelles mitochondries saines et ceci, comme nous le voyons, est lié à ce qui se passe dans l’intestin.

Dysbiose et fatigue mitochondriale, liaisons dangereuses
Notre microbiote est très sensible à nos modes de vie. (…) Cela peut à son tour affecter l’intégrité de la muqueuse intestinale, provoquant une hyperperméabilité intestinale. Cette poro­sité de l’intestin favorise le passage de fragments bactériens ou de parti­cules alimentaires non digérées dans la circulation sanguine, avec comme conséquence une activation de notre système immunitaire et une inflammation systémique.
Lors d’une dysbiose, nous avons beaucoup de bactéries gram néga­tif qui ont le pouvoir de générer des LPS (lipopolysaccharides) et des endotoxines, lesquelles ont un fort pouvoir inflammatoire si elles passent la barrière intestinale (12). (…) Cette endotoxinémie va affecter nos mitochondries de plusieurs façons. Premièrement, elle peut causer des dommages directs sur la mitochondrie, qui peut percevoir ces endotoxines bactériennes comme un signal de danger, provoquant une baisse de production d’énergie de la mitochondrie. Celle-ci passe alors en mode de défense (13). On sait, par exemple, que chez les personnes souffrant de fatigue chronique, on retrouve une diversité diminuée du microbiote avec un plus grand nombre de bactéries productrices d’endotoxines. Parallèlement, on constate une diminution des bacté­ries impliquées dans la production de métabolites bénéfiques comme le butyrate, les urolithines ou le lactate, qui soutiennent la production d’éner­gie des mitochondries. (14)

3 solutions pour rebooster vos mitochondries
(…) IL existe des solutions simples pour améliorer la santé de nos mitochondries à travers la prise en charge de notre microbiote, comme :
- Augmenter la production d’acides gras à chaîne courte et particulière­ment la production de butyrate ;
- Augmenter la conversion des polyphénols, notamment des ellagi­tanines de certaines baies, fruits et noix, en urolithines et en urolithine A en particulier ;
- Protéger l’intégrité de la barrière intestinale en prenant en charge la perméabilité de l’intestin.
Ces trois axes pratiques auront un impact énorme sur votre santé et votre bien-être en général et, bien sûr, sur la fonction et la production d’énergie de vos mitochondries. Voyons concrètement des straté­gies simples pour effectuer ces changements.

Cure de jouvence mitochondriale
Les probiotiques pourraient agir de différentes manières pour améliorer la fonction des mitochondries, par exemple en favorisant la production d’acides gras à chaîne courte utili­sés par les mitochondries comme source d’énergie. Ils régulent la production de certains métabolites qui peuvent influencer la fonction mitochondriale, ou ils modulent l’expression de certains gènes qui sont impliqués dans la fonction mitochondriale.
NDLR : En cas de dysbiose de fermentation – ça grouille fort – on assainit d’abord avant d’ajouter une couche !

Assainir avant de repeupler le microbiome
En cas de dysbiose de fermentation, il n’est souvent pas opportun d’ajouter une couche supplémentaire de probiotiques sur un milieu sur-réactif / grouillant, en espérant que ce procédé va régulariser / rééquilibrer le microbiote. C’est possible mais souvent trop fastidieux et aléatoire.
Exemple de produits permettant de cibler les excès, sans nuire à la totalité de la flore intestinale :
=> Voir post suivant.

Sources et références
1. SCE 03/2023 – Dr Antonello D’Oro
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Dr Antonello D’Oro, Médecin spécialiste en rhumatologie, formé en médecine nutritionnelle et fonctionnelle, il exerce cette spécialité depuis 15 ans à Genève. Le Dr D’Oro tient également un blog d’information sur la nutrition depuis de nombreuses années ([Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
9. Donohoe DR, « The Microbiome and Butyrate Regulate Energy Metabolism and Autophagy in Mammalian Colon. », Cell Metab, 2011
10. D’amico D, « Impact of the Natural Compound Urolithin A on Health, Disease and Aging. », Trends Mol Med, 2021
11. Andreux PA, « The Mitophagy Activator Urolithin A is Safe and Induces a Molecular Signature Improved Mitochondrial and Cellular Health in Humans. », Nat Metab, 2019
12. Malesza IJ, « High-Fat, Western-Style Diet, Systemic Inflammation, and Gut Microbiota: A Narrative Review. », Cells, 2021. PMID: 34831387
13. Li, « Selective Inhibition of JNK Located on Mitochondria Protects against Mitochondrial Dysfunction and Cell Death Caused by Endoplasmic Reticulum Stress in
Mice with LPSinduced ALI/ARDS. », Int J Mol Med, 2022. PMID: 35514298
14. Ludovic Giloteaux, « Reduced Diversity and Altered Composition of the Gut Microbiome in Individuals with Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome. », Microbiome, 2016 Jun

Différents cas de figure
Quelles huiles essentielles et souches de probiotiques pour équilibrer le microbiote ?
Notez qu’il faut voir ce post comme un document ressources (liens pratiques). En effet, il faudra souvent chercher le pourquoi du comment ailleurs sur le forum, bien qu’il y ait déjà pas mal de « références » données plus bas.
Nous devons envisager les cas de figure suivants pour affiner le traitement de la sphère digestive (non exhaustif) :
Cas N° 1 : Inconfort récent (moins de 2 à 3 mois)
Cas N° 2 : Dysbiose de fermentation
Cas N° 3 : SIBO Protocole. Il faut aussi traiter le biofilm
Cas N° 4 : Idem + MMC insuffisant (Complexe Moteur Migrant)
Cas n° 5 : Biofilm avec soupçon de candidose ou Lyme
Cas N° 6 : SIBO avec méthane / hydrogène
·         Cas N° 1 : Inconfort récent (moins de 2 mois). (1)
HE de menthe poivrée 1 gtte et HE d’Estragon, sur une base, matin et soir (repas). En cure de 4 à 5 jours, renouvelable 2x (espacé de +/ 5 à 8 jours). La menthe aura également un effet anti-histamine ; l’estragon aura un effet modulateur (tonique digestif général : stomachique, apéritive, carminative, lutte contre les gaz).
·         Cas N° 2 : Dysbiose de fermentation (2)
HE d’origan
=> ADP Biotics ou Now Oregano (Now Foods).
·         Cas N° 3 : SIBO Protocole. Il faut aussi traiter le biofilm. (3)
Les virus et bactéries se réfugient souvent derrière un biofilm protecteur, en attendant que l’orage passe.
·         Cas N° 4 : Idem + MMC insuffisant (Complexe Moteur Migrant) (4)
En bref, la motilité intestinale due aux contractions électriques dans les périodes inter-digestives (entre deux repas).
·         Cas n° 5 : Biofilm avec soupçon de candidose ou Lyme (5) 
Cas N° 6 : SIBO avec méthane / hydrogène (6)
=> Voir les posts ou Darky intervient.
Liens utiles :
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Protocole de Nirala Jacobi --> [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien] --> approche Nirala Jacobi [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
[Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien] (MMC)

*) Sources et Approvisionnement
1) J’achète l’HE d’estragon sur aroma-zone.
2) HE d’origan entéro-protégée
=> ADP Biotics ou Now Oregano (Now Foods).
a) [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
b) Oregano Oil with Ginger and Fennel Oil, Enteric Coated, 90 Softgels
3a) Voir le post de Darky « Hello de Darky : J’ai le SIBO … »
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Je lirais aussi pour me documenter l’approche du Dr d'Oro :
=> [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
3b) Biofilm
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=> Mix d’enzymes avec Serrapeptase.
4) MMC en détails
Le complexe moteur migrant (ou complexe myoélectrique migrant^{[Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]}, CMM) est une activité électrique et contractile de la motilité digestive qui a lieu dans les périodes inter-digestives (entre deux repas), et interrompu par la prise d'aliments.
Chaque complexe moteur migrant est un cycle constitué de trois phases :

• Phase I : phase de repos
  
• Phase II : phase d'activité irrégulière
  
• Phase III : phase d'activité régulière.
  

Chaque CMM s'accompagne d'un accroissement des sécrétions gastriques, pancréatiques et duodénales. On pense qu'ils servent à évacuer le contenu dans l'intestin grêle entre deux repas, et aussi à transporter les bactéries de l'intestin grêle dans le colon^{[Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]}.
Bonne synthèse du CMM sur Wikipedia : [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
5a) Candidose ou Lyme (tique)
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5b) Maladie de Lyme
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6) SIBO / SIFO
Protocole de Nirala Jacobi --> [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien] --> approche Nirala Jacobi [Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien]
[Vous devez être inscrit et connecté pour voir ce lien] (MMC)

*) Zonuline et perméabilité intestinale
La zonuline est une molécule qui régule la perméabilité de la barrière intestinale. Chez des personnes atteintes par la maladie cœliaque, cette molécule en excès est produite quand du gluten, des saponines en excès ou les lectines sont ingérés. Ils déclenchent / excitent le système en laissent la porte coincée ouverte…
C’est la nuit que nous récupérons et reconstituons l’étanchéité de la barrière en brosse, si nous n’avons pas trop tiré sur la corde, de manière répétée (gluten) et si nous avons apporté les matériaux adéquats.

Glutamine pour les entérocytes et butyrate pour les colonocytes
Le butyrate est le carburant préféré des cellules épithéliales du colon, les colonocytes, contribuant environ à 70 % de ses besoins en énergie.
Glutamine pour l’étanchéité des parois intestinales: 5 gr par prise. Nutrimuscle.com (jusqu’à 20 gr par jour, en 2 ou 3 prises, reparties sur la journée). Pas en cas de candidose, si non maitrisée.
Butyrate pour les colonocytes : « Le butyrate favorise la fonction barrière de l’intestin »
Le Dr. D’Oro préconise souvent, si vous ne consommez pas du beurre ou du ghee régulièrement : On trouve sur le marché du buty­rate en supplémentation ; on peut évoquer quelques marques comme Permeabiane Butyrate LP de chez Pileje (1 gélule 2 fois par jour au moment des repas dans un grand verre d’eau) ou Butycaps du labora­toire Bionoto ou encore Bio-Butyric de chez Biotics (1 à 2 capsules par jour en mangeant, dans un grand verre d’eau). (19)
19. Ryu G, « Urolithin A Induces Mitophagy and Prolongs Lifespan in C. Elegans and Increases Muscle Function in Rodents. » Nat Med, 2016 Aug
Info utile sur le butyrate (acide butyrique) :
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*) Probiotiques en cas de dysbiose afin d’éviter la dégradation et le mode défense
Lors d’une dysbiose, nous avons beaucoup de bactéries gram négatif qui ont le pouvoir de générer des LPS (lipopolysaccharides) et des endotoxines, lesquelles ont un fort pouvoir inflammatoire si elles passent la barrière intestinale (12). (…) Cette endotoxémie va affecter nos mitochondries de plusieurs façons. (…) Cette endotoxémie va affecter nos mitochondries de plusieurs façons. Premièrement, elle peut causer des dommages directs sur la mitochondrie, qui peut percevoir ces endotoxines bactériennes comme un signal de danger, provoquant une baisse de production d’énergie de la mitochondrie. Celle-ci passe alors en mode de défense (13).
Edit: Lorsque l'organisme doit passer en mode survie / défense, il ralentit le métabolisme, ou si vous préférez, le niveau de carburation du moteur. Les ressources sont alors prioritairement utilisées pour le maintien / l'entretien. C'est le mode inné "Protection de l'espèce". 

Les probiotiques, oui, mais multisouches !
Mise en garde : Les probiotiques commerciaux ne contiennent la plupart du temps que quelques souches dont l’efficacité et la résistance à l’acidité gastrique ne sont pas souvent bien documentées scientifiquement.
Le Dr d’Oro propose à ses patients assez souvent la marque Seed (seed.com), à hauteur de 2 capsules par jour,  de préférence hors des repas, qui combine une vingtaine de souches variées de lactobacillus et de bifidobactéries. Notamment :
- Lactobacillus plantarum
La supplémentation chez des souris diabétiques a pu améliorer la fonc¬tion mitochondriale et réduire les niveaux de glucose dans le sang (15).
- Bifidobacterium longum a pu améliorer la fonction mitochondriale et réduire les lésions cérébrales chez des souris souffrant d’Alzheimer (16).
- Bacillus subtilis a permis d’améliorer la fonction mitochondriale et de réduire les dommages chez des souris souffrant de stress oxydatif (17).

Sources et références :
12. Malesza IJ, « High-Fat, Western-Style Diet, Systemic Inflammation, and Gut Microbiota: A Narrative Review. », Cells, 2021. PMID: 34831387
13. Li, « Selective Inhibition of JNK Located on Mitochondria Protects against Mitochondrial Dysfunction and Cell Death Caused by Endoplasmic Reticulum Stress in
Mice with LPSinduced ALI/ARDS. », Int J Mol Med, 2022. PMID: 35514298
14. Ludovic Giloteaux, « Reduced Diversity and Altered Composition of the Gut Microbiome in Individuals with Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome. », Microbiome, 2016 Jun 23;4(1):30
15. Cai X, « Lactobacillus plantarum Ameliorates Diabetic Symptoms by Modulating the Gut Microbiota and Improving Mitochondrial Function in Type 2 Diabetic Mice. », Journal of Diabetes, 2019, 11(1), 77-87
16. Shi, « Bifidobacterium longum Attenuates Cognitive Decline and Reduces Amyloid-β Plaque Burden in the APP/PS1 Mouse Model of Alzheimer’s Disease. », Brain Research,2017 :147-155
17. Feng J, « Bacillus subtilis Improves Oxidative Stress-Induced Damage in Mice. », Oxidative Medicine and Cellular Longevity, 2013, 814157

*) Les prébiotiques anti-stress oxydatif (si pas de dysbiose présente, ou alors sous contrôle, càd en période d’entretien) :
Le Dr D’Oro prescrit régulièrement : Pour les personnes qui souffrent d’un côlon irritable, il  conseille l’Optifibre (5 à 10 g par jour) ou/et la fibre d’acacia (par exemple Prebiosoft de chez Nutrixeal – 1 à 6 dosettes par jour). Pour les autres personnes, on peut prendre des mélanges de plusieurs sources différentes, par exemple FiberMend de chez Thorne (2 dosettes par jour diluées dans une boisson) ou Prebiolin de chez Nu3 (5 g par jour dilués dans une bois­son). Ces marques sont données à titre personnel, mais il existe de nombreuses autres marques efficaces et de bonne qualité.
Le postbiotique préféré du Dr D’oro : l’urolithine A
Il est temps de parler de l’un des postbiotiques les plus prometteurs : l’urolithine A. L’urolithine A est un composé naturel produit par les bactéries intestinales à partir des ellagitanines et de l’acide ellagique que l’on trouve dans les aliments tels que la grenade, les baies et les noix. Récemment, de nombreuses recherches ont montré son impact sur le vieillissement et la maladie grâce à sa capacité à augmenter la mitophagie et la fonction mitochondriale, ainsi qu’à réduire l’inflammation (19). De nouvelles recherches continuent à explorer et à démontrer le potentiel incroyable de cette molécule.
=> Ellagine / Ellagitannins dans les framboises et la grenade (classe de polyphénols).
=> Recherche avec Pomegranate extracts / grenade fermentée & acide ellagique. La grenade doit être fermentée pour décupler les effets.
Granaprosan (gélules) ou GranaFORTE (sirop) de Dr. Jacob's. Ou du jus de grenade fermentée, assez écœurant mais ça passe +/ dans du jus d’orange additionné d’une càs de jus de citron, avec un prix plus compétitif. Testé et approuvé. 
=> Pomixir jus de grenade concentré d’Elite Naturel 500 ml
Chez greenweez.com ou amazon.fr +/ 39 € (prix surfait).
Chez naturaleform.fr  (prix normal +/ 29 €).
Se conserve très longtemps au frigo.

Source et Référence:
19. Ryu G, « Urolithin A Induces Mitophagy and Prolongs Lifespan in C. Elegans and Increases Muscle Function in Rodents. » Nat Med, 2016 Aug

*) Cette vitamine « répare » vos mitochondries
La vitamine K2 est d’origine animale et plus précisément d’ori­gine bactérienne. Elle est issue de la biosynthèse de certaines bacté­ries. (…)  
Il s’avère que les bactéries utilisent la vitamine K2 (MK-7) comme prin­cipal récepteur dans leur système de transport d’électrons. Alors souvenez-vous du cycle de Krebs qui alimente ensuite le système de transport d’électrons. Le système de transport d’électrons contient des composés comme les ubiquinols (Co-Q10) qui font la navette avec le mécanisme de transport pour produire de l’ATP. Chez l’homme, nous utilisons de la Co-Q10 ou des ubiquinols, mais il s’avère que nous utilisons également de la vitamine K2 (MK-7). On a pu également démontrer que la vita­mine K2-7 était capable de réparer les mitochondries endommagées et d’augmenter l’énergie des cellules cérébrales, protégeant ainsi des maladies neurodégénératives (20).
Sources et Références:
20. R Y Yang, « Menaquinone-7 Protects Astrocytes by Regulating Mitochondrial Function and Inflammatory Response Under Hypoxic Conditions. », Eur Rev Med Pharmacol Sci, 2020 Oct;24(19):10181-10193Ryu G « Urolithin A Induces Mitophagy and Prolongs Lifespan in C. Elegans and Increases Muscle Function in Rodents. », Nat Med, 2016 Aug
- Liens utiles: 
Vit K Mk4 Vs Mk7 update 02 2020
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Absorption, stockage, biodisponibilité et tissus cibles des ménaquinones (K2)
Dosage thérapeutique de la vitamine K
Exemples pour achat de vitamine K2.
2) Vit K et risque de thrombose
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Il n'y a pas que K1 qui joue un rôle dans la coagulation.
K2 est safe jusque 150 mcg. Vu son intérêt pour la prévention dans plusieurs pathologies, ce serait idiot de ne pas en profiter ...